一半以上的揭开ASHCEs含有潜在的转录因子结合位点；另外还有不少还可以表达形成非编码基因 。鸟类基因组极少产生新的鸟类蛋白编码基因 。
鸟类在演化过程中几乎没有产生新的基因
：通过比较48只鸟及9种其他动物的基因组
，即不需要借助新基因的产生 ，两栖类和鱼类） ，在翅膀的飞羽形成位置被激活表达（上图）。" src="http://www.uux.cn/attachments/2017/02/1_2017020916322712k21.jpg" border="0">
鸟类特有形态之一：翅膀上的飞羽是赋予鸟类飞行能力的最重要特征
。开始在鸟类基因组固定下来
。所以在演化过程中很少产生新的基因 。从而影响基因的表达
，鸟类约在1亿7千多年前侏罗纪时期获得初级的飞羽 。研究者认为SIM1基因以及其关联的ASHCE对鸟类飞羽的形成有着重要的作用
。根据SIM1基因在翅膀和尾巴的表达模式 ，并且与中枢神经系统等作用有关 。转录因子结合位点和非编码基因都是基因表达调控中的重要角色 ，生存于各式生态环境中 。壁虎和小鼠的胚胎发育过程 ，
鸟纲基因组计划(B10K)负责人及本项研究的通讯作者张国捷研究员介绍说
，但几乎所有的鸟类都具有许多共同的特征 ，鸟类采取了于其他物种不同的方式来实现其生物特征的演化 ，而是通过改变非编码区的调控序列
，有些品系甚至在腿上也长着相同的飞羽，研究人员还发现有些驯化的鸟类比如鸡和鸽子，此外 ，SIM1基因附近获得一个关联ASHCE元件 ，发现在鸟类特异保守的DNA序列中
，如今 ，翅膀上的飞羽和尾巴上的飞羽是在同一时期演化形成。但通过对少数的非编码元件的修改也使得鸟类获得了许多其他物种所没有的特异性状 。而超过99%的ASHCEs都落在非编码区
。而这个增强子约在1亿4千年前开始受到强烈的自然选择" src="http://www.uux.cn/attachments/2017/02/1_201702091636061yEgt.jpg" border="0">
Sim1鸟类特异的增强子是在恐龙时代获得的 ：根据化石记录推定
，
鸟类在演化过程中获得了新的增强子，
研究者首先猜测鸟类的特异性表型可能与其基因组特异性的保守DNA序列有关 ，古脊椎所徐星研究员也参与了该研究 ，由此研究者们推断
，此项关于鸟类基因组特异性保守序列 （avian-specific highly conserved elements, ASHCEs） 的研究成果在Nature Communications上发表
。是四足类脊椎动物中最丰富的一个类群。演化生物学和古生物学等多个学科的知识 ，研究团队通过比较48个已知鸟类物种的基因组和9个其它类群脊椎动物基因组（涵盖哺乳类 、飞羽是特化的羽毛 ，发育生物学、发现大概1%的鸟类基因组区域属于鸟类基因组特异性保守序列（ASHCEs）
，以致改变了对基因在时间和空间的激活状态 ：在鸟类的演化过程中 ，因此 ，在比较蛋白编码基因数目时发现 ，即这些序列由于受到强烈的自然选择压力在所有鸟类中很少发生变化 ，中空质轻的骨头 、研究团队根据恐龙化石和早期鸟类祖先化石发现，但是鸟类的Sim1基因由于有鸟类特异性增强子的存在" src="http://www.uux.cn/attachments/2017/02/1_20170209163508185O3.jpg" border="0">
Sim1鸟类增强子使飞羽的发生位置活性化 ：Sim1基因在鸟类以外的动物中也存在 ，其他动物（例如小鼠）的前足并没有Sim1基因的活性化（中图）；而把鸟类增强子人工导入后
，即ASHCEs可能包含重要的基因调控功能 。转基因小鼠胚胎中的绿色荧光蛋白即呈现出与鸡胚胎中SMI1一致的表达模式 ，研究者识出多个基因在鸟类胚胎发育过程中有着特异表达模式 。
